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GST pulldown

GST pull-down实验是一个行之有效的验证酵母双杂交系统的体外试验技术,近年来越来越受到广大学者的青睐。

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实验介绍

【技术原理】

GST pulldown实验是一个有效验证酵母双杂交系统的体外试验技术。

基本原理:将靶蛋白-GST 融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,作为与目的蛋白亲和的支撑物,充当一种“诱饵蛋白”,目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”(目的蛋白),洗脱结合物通过 SDS-PAGE 电泳分离,最后经western blot或质谱分析,从而证实两种蛋白间的相互作用;

        1. 确定某一个蛋白质与另一个蛋白质的直接作用关系。

        2. 筛选某一个蛋白质直接结合的蛋白质族群。

        3. 验证酵母双杂交系统结果的有效性。

        
【技术原理图】



案例展示

优势与不足

优势:

1. 区别于CoIP,GST pull down技术可以明确两个蛋白质之间是否直接作用。

2. 可用于筛选与目的蛋白质直接结合的蛋白质族群。

3. 可联合酵母双杂交系统综合评估蛋白质之间的相互作用关系,是一个有效的验证酵母双杂交系统的体外试验技术。

不足:

1. 体外表达的重组蛋白,无法完全模拟特定生理状态下的蛋白质活性及结合情况。


送检与交付标准

样品类型样品需求保存条件运输条件备注
动物组织单个样品>0.1g,2mlEP管或冻存管装,不要过量;样本应尽量新鲜,如不能立即提取蛋白或核酸,应液氮速冻后冻存于-80℃或更低,冻存样本避免反复冻融以致降解-80℃干冰所有样本均须有唯一标记,且标记清晰可识
种子样本去壳新鲜或保存于液氮中的的种子样本,单个样品>0.2g。-80℃干冰
贴壁/悬浮细胞

1. 总RNA或蛋白:106cell/指标、浆/核RNA或蛋白:107cell/指标、线粒体RNA或蛋白:2*107     cell/指标,样本尽量新鲜,细胞收取后直接加Trizol(QPCR检测)或直接冻存于-80℃       

2. 若细胞处理(加药、转染、感染)后状态差应酌情加大收样量

-80℃干冰
全血/血清样品用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白细胞匀浆>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。-80℃干冰
石蜡包埋样品由标准的石蜡包埋盒包埋的石蜡块,有效厚度大于 0.1cm; 新鲜的 FFPE 组织切片,每片厚度不超过 10μm,2~8 张,表面积不超过 250mm2。-20℃冰袋
抗体

1. 按样本种属提供满足相应实验要求的抗体;

2. 按抗体说明书要求寄送,尽量避免分装;如分装,确保量足够进行实验,并提供抗体说明书。

3.保存抗体的抗体管上应有能够识别此抗体的标记,抗体的量应大于实验所需的量。

-20℃冰袋
引物干粉,≥1OD,如进行预实验,每个基因至少提供两对引物, 附带公司引物合成单。-20℃冰袋或常温




细胞交付标准.jpg