WB样本粘稠怎么办?
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
你是否会碰到这样的问题:在提取WB样本的时候,加入裂解液后,离心发现管内有非常多的胶状物质,非常粘稠,即使多加裂解液也是无用,还会使得蛋白浓度降低。蛋白样本若出现粘稠的情况,会对后续的检测造成一定的影响,导致检测结果不可靠,所以今天我们来研究一下导致的原因——普拉特泽生物承接WB等分子检测相关服务上万例,积累了操作大量经验,为大家详细分享WB样本粘稠问题,同时为广大科研工作者开展线上的理论培训与线下实操,可承接wb实验外包服务。
【一】、蛋白样本粘稠会造成什么情况?
1.样品洗液困难:堵塞移液器:离心后,由于样品粘稠,胶状物会堵塞移液器头,导致移液后上清液所剩无几;无法分离上清液:样品太过粘稠,移液时容易整体带出,无法有效分离上清液。
2.无法测定及定量:样品粘稠无法成为均一液体,导致蛋白定量(如使用BCA法)时OD值异常,无法进行准确的定量测定。
3.上样困难:尽管加了loading buffer进行煮样,上样样品仍然特别粘稠,很难加入到胶孔中
电泳结果不佳:SDS-PAGE时,粘稠的样品会卡在点样孔里,导致条带不成直线,有严重拖尾,条带不集中
4.蛋白丢失:粘稠物包裹蛋白导致无法释放,样品很难跑出理想的结果,有时甚至是完全没有条带。
【二】那么是什么造成蛋白质样本如此粘稠的呢?
1.核酸残团:在细胞裂解过程中,细胞中的DNA缠绕其他大分子物质,形成粘稠的“核酸残团”。这些核酸残团与蛋白质聚集在一起,使得样本变得粘稠。核酸残团的存在会降低蛋白提取效率,使得蛋白质丢失。
2.细胞碎片和油脂:裂解后的样本中可能含有细胞碎片,如油脂、难溶蛋白等。这些成分也会增加样本的粘稠度。
【三】如何有效降低蛋白样本的粘稠?
1.使用柱式法提取蛋白:柱式法蛋白提取通过优化的裂解液配方和离心管柱技术,可以有效提高裂解效率,阻截核酸,减少样本粘稠度。
2.超声破碎:利用超声波的能量破坏蛋白复合物,切割染色质,改善样本粘稠状态。但是超声处理可能产生泡沫,影响蛋白浓度测定及后续实验。超声产生的热量可能导致蛋白质变性或降解,因此应避免用于磷酸化等敏感蛋白的研究。
3.使用核酸酶降解核酸:核酸酶可以降解样本中的核酸,减少核酸残团的形成,从而降低样本粘稠度。
4.延长煮沸时间:在加入上样缓冲液后,适当延长煮沸时间,可以使结合在基因组DNA上的蛋白充分释放,同时导致基因组DNA的部分断裂,降低样本粘稠度。
5.反复抽吸:使用注射器反复抽吸样本,可以打断基因组DNA,改善样本粘稠状态。
冰冻三尺,非一日之寒,普拉特泽致力于帮助广大科研工作者解决WB实验过程中的各方面问题,不但授人以鱼,亦授人以渔。