northern blot实验作用和原理
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
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Northern blot是一种用于检测RNA的分子生物学技术,与Southern blot(用于检测DNA)和Western blot(用于检测蛋白质)等技术类似。Northern blot通常用于检测RNA是否存在、其大小和数量,并可定性和定量研究RNA的表达模式和调控机制。以下是northern blot的主要作用和原理。
1. 主要作用
Northern blot可以确定RNA是否在一个样品中存在,并帮助确定RNA的含量。它可以帮助检测低水平表达的RNA,从而了解RNA在某个组织或细胞类型中的表达情况。
Northern blot可以区分不同的RNA亚型,例如小RNA和长RNA,mRNA和非编码RNA等。通过使用DNA探针,可以鉴别与这些RNA序列特异结合的探针,以进一步确定RNA亚型的存在。
Northen blot可以定量RNA表达水平,可以根据信号强度比较不同样品之间同种RNA的表达水平。此外,组织和发育上的差异可以通过对不同来源RNA的表达进行比较来研究。
2. 原理
从样品中提取RNA后,通过琼脂糖凝胶电泳将RNA分离成不同的大小,然后将RNA转移到固体支持介质例如尼龙或硝酸纤维素膜上。通过使用标记有互补序列(probe)的单链DNA或RNA来特异性识别Ladder以及样本RNA而不与其他RNA结合,并且其中的放射性或非放射性等探针可以较敏感地检测到RNA的存在。
如果特异序列为金属离子或biotin识别基元,则可使用针对其的抗体或联合化学发光技术来检测RNA。通常,northern blot信息是通过比较参考RNA和目标RNA的信号强度来解释的,可以通过量化该相对强度来获得RNA表达水平的定量数据。
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