在表观遗传科研中，DNA甲基化绝对是高频研究方向。无论是肿瘤机制、疾病标志物筛选，还是基因表达调控研究，启动子区CpG位点的甲基化状态分析，都是核心实验手段。      而做甲基化检测，绕不开MSP（甲基化特异性PCR）和BSP（亚硫酸氢盐测序PCR）这两种经典方法。

做WB的小伙伴都知道，实验辛苦熬胶、转膜、孵育一抗二抗，最后成败全看条带好不好看。很多时候我们肉眼看着条带深浅差不多，实际统计结果却差异巨大，核心问题就出在灰度值分析上。

很多科研人做转录调控研究时会遇到瓶颈：基因序列无差异，但基因表达、表型却出现显著变化，常规转录组测序完全无法解释机制。这时，动态可逆的RNA甲基化修饰往往就是关键答案。不同于稳定的DNA甲基化，RNA甲基化具有动态性、组织特异性、时空特异性，检测难度更高。市面上LC-MS/MS、MeRIP-seq、miCLIP-seq等技术层出不穷，到底该测整体甲基化水平，还是做全转录组位点定位？不同实验该如何选型？这篇推文一次性讲清楚，帮你精准匹配课题需求。

DNA 甲基化是一种重要的​​表观遗传修饰​​形式，不改变 DNA 序列但可遗传。在哺乳动物中，甲基化通常发生在胞嘧啶（C）上，尤其是在​​CpG 岛​​（含有大量 CpG 二核苷酸的区域）内的胞嘧啶上。当 CpG 岛发生高甲基化时，会抑制下游基因的表达，这种变化可能早于细胞形态学异常，是癌症发生的早期分子事件。