2021-10-26
m6A甲基化研究思路设计方法
MeCP2与甲基转移酶14(METTL14)结合,通过改变m6A甲基化修饰来调节肿瘤抑制因子KLF4的表达,进而影响结直肠癌的进展。
2021-10-26
MeCP2与甲基转移酶14(METTL14)结合,通过改变m6A甲基化修饰来调节肿瘤抑制因子KLF4的表达,进而影响结直肠癌的进展。
2021-10-26
作者通过他们前面的研究中筛选出CIB1这个蛋白作为研究目标,通过对临床组织进行一系列实验以及了解CIB1对肺腺癌的预后情况,再在细胞层面上过表达/敲除CIB1得到其对肺腺癌细胞功能学实验的影响。其次,通过Co-IP和质谱筛选出与CIB1结合的蛋白CHIP,通过一系列实验证明了CHIP可以通过泛素-降解途径影响CIB1的表达,并得到泛素的K48以及CIB1的K10和K65位点参与CHIP对CIB1的表达。最后,采用回复实验,在细胞层面和动物层面验证CHIP对CIB1的调控关系。
2021-10-18
1. 创新型除了与探究的lncRNA的机制有关,也与研究的下游表型,以及lncRNA本身有关。并不是说哪种机制就更新颖。2. RIP,RNA pull down,CHIP,Co-IP这些技术是研究lncRNA与蛋白关系的关键技术,如果想要往这方面尝试的同学务必掌握牢固。3. 综合两种以上的机制,甚至是将ceRNA也融合进来,是常用的增加文章的层次的方法。
2021-10-13
作者发现HDAC8的抑制能降低胶质瘤的生成,延长小鼠的生存周期。 研究发现HDAC8调节α-tubulin蛋白乙酰化从而驱动胶质瘤细胞迁移和侵袭。 研究HDAC8对GAMs迁移及抗炎表型的调控作用。最后,探讨HDAC8能否触发NK细胞中的NKG2D,从而增强其细胞毒性。
2021-10-12
参与m6A的蛋白可以分为writers,erasers和readers三类,其中writers往核苷酸上添加上甲基,erasers去掉核苷酸上的甲基,readers则是能够识别带有甲基修饰的核酸序列。
2021-10-09
关于lncRNA与转录因子的技术总结 1. LncRNA可以受转录因子的调控,也可以调控转录因子的功能,这两种功能可以单独成文,也可以串起来增加文章的丰度。 2. 由于肿瘤的缺氧特性,HIF-1α是最常用作lncRNA的上游调控的转录因子,除了HIF-1α外,还有SP1, P53,也常有文献报道。 3. 上述这篇文献的实验设计很精致,可以作为此套路的范例参考。
2021-09-29
关于lncRNA与RBP的技术总结 1. 关键的验证内容是lncRNA与RBP的结合,以及lncRNA对RBP与mRNA结合稳定性的调控 2. 一般来说不需要再深入研究lncRNA与RBP的机制 3. RBP存在功能多样性,可以正向,负向调控下游mRNA的稳定性 4. 如果没有做质谱的条件,也可以参考预测软件的结果找到lncRNA可能结合的RBP
2021-09-27
本文中,发现CD3 +CD4−CD8−T细胞(双阴性T细胞,DNT细胞),与年龄匹配的健康受试者相比,急性脑卒中患者外周血中DNT比例显著提高。有趣的是,在脑卒中患者和大脑中动脉闭塞小鼠的缺血脑组织中,浸润性DNT主要位于小胶质细胞附近。DNT使小胶质细胞像促炎小胶质细胞发展,进而增强了神经炎症,加重了缺血性脑卒中后的脑损伤。机制上,DNT固有的FasL和PTPN2通过TNF-α的产生协同调节促炎小胶质细胞的发展。综上,浸润的DNT是促进小胶质细胞介导的神经炎症和缺血性脑损伤的关键驱动力。
2021-09-22
一种新的环状RNA,即circDIDO1,在GC中具有强大的抑癌活性。 可分别通过抑制PARP1和促进PRDX2泛素化降解,一起抑制GC细胞的生长和侵袭性。circDIDO1编码了一个新的529 aa蛋白,该蛋白直接与聚adp -核糖聚合酶1 (PARP1)相互作用并抑制其活性。 CircDIDO1还特异性结合过氧化物还原蛋白2 (PRDX2),促进rbx1介导的PRDX2的泛素化和降解,导致其下游信号通路失活。研究扩展了对circRNA在胃癌发病机制中的作用的理解,并提出了一种新的circRNA,circDIDO1作为GC的潜在生物标志物。
2021-09-22
circRNA(circular RNA,环形RNA)是非编码RNA分子的一种,它具有以共价键形成闭合环状结构, 不存在有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴。circRNA大量存在于真核转录组中,不受RNA外切酶影响,表达更稳定不易降解。相当一部分circRNA都是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。
2021-09-14
内参就是内部参照,一般是指管家基因编码表达的蛋白,它们在各个组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照参。内参则可以校正蛋白质定量、上样过程中存在的误差,保证实验结果的准确性。此外,内参可以作为空白对照,还可以检测蛋白转膜情况是否完全、整个WB显色发光体系是否正常。内参抗体种类很多,比如β-Actin、β-Tubulin、GAPDH等,下面简单介绍下如何选择内参。
2021-09-13
HIF-2α通过激活缺氧诱导的脂滴相关蛋白表达,抑制GPX4表达,从而增加透明细胞癌对铁死亡的敏感性.

400-691-6686

18570028002