CHIP实验的简介与原理由普拉特泽生物旗下科研培训品牌——春风学院为大家总结分享。CHIP是普拉特泽分子检测平台的常规实验，有着极其成熟的技术经验，实操熟练，周期短，我们专业承接CHIP等各类生物医学实验外包服务，值得信赖~

   CHIP即染色质免疫沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation），是在全基因组水平研究生命体组织或细胞内蛋白质与DNA相互作用的一种技术方法。

   核酸和蛋白质是组成生命的主要生物大分子，两者的相互作用是构成生命活动的生长、繁殖、运动、遗传和代谢等生命活动的基础。研究蛋白质和核酸间的相互作用是人们探索生命现象奥秘的关键，CHIP检测实验是应用于蛋白与核酸互作关系的重要参考。

   CHIP利用抗原抗体反应的特异性，可以真实地反映蛋白质与基因组DNA结合的状况。特别是由于该技术不断的发展和完善，其应用范围已经从研究目的蛋白与已知靶序列间的相互作用，发展到研究目的蛋白与整个基因组的未知序列的相互作用；从研究一个目的蛋白与DNA的相互作用，发展到研究两个蛋白与DNA共同结合的相互作用；从研究启动子区域的组蛋白的修饰，发展到研究结合在DNA序列上的蛋白复合物。

   CHIP染色质免疫沉淀技术的原理是：在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起，通过超声或酶处理将染色质切为小片段后，利用抗原抗体的特异性识别反应，将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来。染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定，染色质断裂，染色质免疫沉淀，交联反应的逆转，DNA的纯化，以及DNA的鉴定。因为ChIP实验涉及的步骤多，结果的重复性较差，所以对ChIP实验过程的每一步都应设计相应的对照，而且对结果的分析也需要有一定的经验。

   CHIP的类型：最常见的单基因分析和全基因组分析方法分别是qPCR 和CHIP-seq。

   CHIP-PCR的优点：CHIP-PCR可用来分析基因组中一部分已知靶标位点上的组蛋白修饰和/或蛋白结合情况。在CHIP-PCR 中，使用广泛提供的PCR 或qPCR 试剂和技术可检测和定量免疫富集的DNA片段。使用CHIP-qPCR 可以对多种样品中的特定基因组区域进行快速和定量比较。这比全基因组测序方法更便宜，更省时。

   ChIP-芯片的优点：ChIP-芯片技术是指使用一个DNA 微阵列芯片来分析经CHIP免疫富集的DNA片段。使用基因组覆瓦式微阵列技术可以对结合分离 DNA 的蛋白进行全基因组分析，并产生一个高分辨率的有关蛋白结合和蛋白修饰的基因组图。CHIP-芯片在基础研究和疾病研究中有多种用途。例如，可用来检测转录因子、增强子和阻遏蛋白的结合位点，并比较对照和病理性样品中的这些结合蛋白种类。但NGS的成本大幅下降，并且使用CHIP-seq 也能获得类似结果，因此更多的人会选择进行CHIP-seq，而不是CHIP-芯片。

    ChIP-seq的优点：与ChIP-芯片类似，CHIP-seq 提供有关全基因组蛋白结合的信息。但不像CHIP-芯片，CHIP-seq 使用 NGS 技术来检测 DNA 片段，并根据整个基因组将其绘制成图。有了更现代的DNA 扩增技术，可以在数日之内对少量输入DNA 进行稳健分析。当起始材料较稀有时，在库制备方法方面取得的这些技术性进展会使ChIP-seq 实验成为可能。此外，有了使用短序列（称为条形码）独特地标记DNA样品的新技术，现在可以将个别片段汇集到一个测序泳道中，以便进行多重分析。这大大提升了DNA 测序实验的效率，并降低了成本，从而进一步支持CHIP seq 应用。

   好啦，关于ChIP实验的简介我们就讲完啦，还有不懂的或者需要补充的同学欢迎随时留言补充，为文章添砖加瓦让其更全面。想要视频学习的同学请戳：CHIP实验 理论+实操