CHIP实验操作详细步骤【附视频教程】
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
CHIP实验操作步骤由普拉特泽生物分子检测平台和线上培训品牌《春风学院》总结分享,文章末附上chip实验原理与操作视频教程,普拉特泽生物承接线下chip实验代做上千例,积累了想当结实的理论基础与实验操作经验,专业代做各种生物医学实验,为科研工作者的枯燥实验生涯提供真诚的帮助,如果您也有chip实验外包需求,一定要考虑普拉特泽哦。
下面我们就来看看chip实验的详细操作步骤吧!
第一步、细胞的甲醛交联与超声破碎。
(1)取出细胞,加入甲醛,使得甲醛的终浓度为1%。
(2)37℃孵育10 min。
(3)终止交联。
(4)吸尽培养基,用冰冷的PBS清洗细胞2次。
(5)细胞刮刀收集细胞于15 mL离心管中。预冷后离心收集细胞。
(6)倒去上清。
(7)超声破碎。
第二步、除杂及抗体哺育
(1)超声破碎结束后,离心去除不溶物质。
(2)在100μL的超声破碎产物中,加入900μLChIP Dilution Bufer 和20μl × PIC。再各加入60μL ProteinA Agarose/Salmon Sperm DNA。4°C颠转混匀1h。
(3)1h后,在4摄氏度静置10 min沉淀,700 rpm离心1 min。
(4)取上清。各留取20 μL做为input。一管中加入1 μL抗体,另一管中则不加抗体。4°C颠转过夜。
第三步、检验超声破碎的效果
(1)取100 μL超声破碎后产物,加入4 μL5M NaCl,65°C处理2h解交联。分出一半用酚/氯仿抽提。
(2)电泳检测超声效果。
第四步、免疫复合物的沉淀及清洗(第二天)
(1)孵育过夜后,每管中加入60 μLProteinA Agarose/Salmon Sperm DNA。4°C颠转2h。
(2)4°C静置10 min后,离心除去上清。
(3)清洗沉淀复合物。清洗的步骤:加入溶液,在4°C颠转10 min,4°C静置10 min沉淀,700 rpm离心1 min,除去上清。
(4)清洗完毕后,开始洗脱。
(5)解交联:每管中加入20 μL 5M NaCl(NaCl终浓度为0.2M)。混匀,65°C解交联过夜。
第五步、DNA样品的回收(第三天)
(1)解交联结束后,每管加入1μL RNaseA(MBI) ,37°C孵育1h。
(2)每管加入10 μL 0.5M EDTA,20μL 1M Tris-HCl(pH6.5),2 μL 10mg/mL蛋白酶K。45°C处理2h。
(3)DNA片段的回收omega胶回收试剂盒。最终的样品溶于100μL ddH2O。
第六步、PCR分析
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