什么是亚硫酸氢钠测序?【甲基化检测外包】
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
亚硫酸氢钠测序法(BSP)实验介绍由普拉特泽生物为大家总结分享。亚硫酸氢盐测序是检测细胞或组织中全部染色体DNA上甲基化情况的技术。普拉特泽生物表达检测平台专业提供亚硫酸氢钠测序实验外包服务,本文我们先来看看亚硫酸氢钠测序法的实验介绍~
亚硫酸氢钠测序法(BSP)是基于亚硫酸氢盐能使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,行PCR扩增所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶,然后对PCR产物进行高通量测序。通过分析不同样品之间的甲基化差异,可研究DNA甲基化水平对基因表达的调控。
直接测序法是建立在 MSP 基础上进一步深入研究 CpG 岛各个位点甲基化情况的方法。重亚硫酸盐使 DNA 中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,行PCR 扩增(引物设计时尽量避免有 CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后,对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较,判断是否CpG位点发生甲基化。
亚硫酸氢钠测序法是一种可靠性及精确度很高的方法,能明确目的片段中每一个 CpG 位点的甲基化状态。在寻找有意义的关键性 CpG 位点上,有其他方法无法比拟的优点。测序法以 CpG 岛两侧不含 CpG 点的一段序列为引物配对区,所以能够同时扩增出甲基化和非甲基化靶序列。它的不足是耗费时间和耗资过多,至少要测序 10 个以上的克隆才能获得可靠数据,同时需要大量的克隆及质粒提取测序,过程较为繁琐、昂贵。
亚硫酸氢钠测序法的简单实验流程如下:
1、引物设计与测试;
2、基因组提取;
3、亚硫酸氢钠修饰DNA并纯化回收修饰产物;
4、PCR扩增、产物回收并连入T载;
5、测序分析;
6、甲基化分析与数据统计。
亚硫酸氢钠测序法我们先简单介绍到这里啦,下期咱们分步详细讲解BSP实验的实验步骤,如果您有还有关于BSP实验的问题或有BSP检测外包的需求欢迎随时联系普拉特泽~