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什么是亚硫酸氢钠测序?【甲基化检测外包】

2022-11-18 15:47:24

来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台

  亚硫酸氢钠测序法BSP)实验介绍由普拉特泽生物为大家总结分享。亚硫酸氢盐测序是检测细胞或组织中全部染色体DNA上甲基化情况的技术。普拉特泽生物表达检测平台专业提供亚硫酸氢钠测序实验外包服务,本文我们先来看看亚硫酸氢钠测序法的实验介绍~

  亚硫酸氢钠测序法(BSP)是基于亚硫酸氢盐能使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,行PCR扩增所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶,然后对PCR产物进行高通量测序。通过分析不同样品之间的甲基化差异,可研究DNA甲基化水平对基因表达的调控

  直接测序法是建立在 MSP 基础上进一步深入研究 CpG 岛各个位点甲基化情况的方法重亚硫酸盐使 DNA 中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶而甲基化的胞嘧啶保持不变PCR 扩增(引物设计时尽量避免有 CpG以免受甲基化因素的影响)所需片段则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶最后PCR产物进行测序并且与未经处理的序列比较判断是否CpG位点发生甲基化

  亚硫酸氢钠测序法一种可靠性及精确度很高的方法能明确目的片段中每一个 CpG 位点的甲基化状态在寻找有意义的关键性 CpG 位点上有其他方法无法比拟的优点测序法以 CpG 岛两侧不含 CpG 点的一段序列为引物配对区所以能够同时扩增出甲基化和非甲基化靶序列它的不足是耗费时间和耗资过多至少要测序 10 个以上的克隆才能获得可靠数据,同时需要大量的克隆及质粒提取测序过程较为繁琐、昂贵

  亚硫酸氢钠测序法的简单实验流程如下:

        1、引物设计与测试;

        2、基因组提取;

        3、亚硫酸氢钠修饰DNA并纯化回收修饰产物;

        4PCR扩增、产物回收并连入T载;

        5、测序分析;

        6、甲基化分析与数据统计。

  亚硫酸氢钠测序法我们先简单介绍到这里啦,下期咱们分步详细讲解BSP实验的实验步骤,如果您有还有关于BSP实验的问题或有BSP检测外包的需求欢迎随时联系普拉特泽~