Northern Blot印迹杂交实验详细操作步骤
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
Northern Blot印迹杂交实验操作步骤由普拉特泽生物总结分享,Northern Blot是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法,普拉特泽生物分子检测平台专业承接Northern Blot实验外包代做服务,实验真,周期短,值得信赖。
图片来源《Feedback inhibition of L1 and alu retrotransposition through altered double strand break repair kinetics》
Northern Blot实验详细操作步骤:
1、总RNA提取。
2、变性胶的制备:取琼脂糖0.2g,加入DEPC H2O12.4 ml,加热融化,于保温状态下加入5×甲醛凝胶电泳缓冲液4.0ml、37%甲醛3.6ml,混匀、制胶。待胶凝固后,置1×甲醛凝胶电泳缓冲液中预电泳5min。
3、样品制备:取总RNA4.5μl(约20-30μg) ,加入5×甲醛凝胶电泳缓冲液 4.0μl、37%甲醛3.6μl、甲酰胺10μl,65℃温育15min、冰浴5min。加入EB(1μg/μl)1μl、上样缓冲液2μl。
4、电泳:上样,50V电泳(电泳时间约2hr左右)。电泳结束后将胶块置紫外灯下,观察RNA的完整性,记录18S、28S条带的位置(离加样孔的距离)。
5、将RNA从变性胶转移到硝酸纤维素膜或尼龙膜:
① 按胶块大小剪取膜一张,用DEPC水中浸湿后,置于20×SSC中浸泡1hr。剪去膜一角。将胶块切去一角,并在20×SSC浸泡15min×2次。
② 用长和宽均大于凝胶的一块有机玻璃板作为平台,将其放入大的干烤皿上,上面放一张Whatman 3MM滤纸,倒入20×SSC使液面略低于平台表面,当平台上方的3MM滤纸湿透后,用玻棒赶出所有气泡。
③ 将凝胶翻转后置于平台上湿润的3MM滤纸中央,3MM滤纸和凝胶之间不能滞留气泡。
④ 用Parafilm膜围绕凝胶四周,以此作为屏障,阻止液体自液池直接流至胶上方的纸巾。
⑤ 在凝胶上方放置预先已浸湿的尼龙膜,排除膜与凝胶之间的气泡。
⑥ 将二张已湿润的、与凝胶大小相同的3MM滤纸置于膜的上方,排除滤纸与滤膜之间的气泡。
⑦将一叠(5-8cm厚)略小于3MM滤纸的纸巾置于3MM滤纸的上方,并在纸巾上方放一块玻璃,然后用一个重约500克的重物压在玻璃板上。其目的是建立液体自液池经凝胶向膜上行流路,以洗脱凝胶中的RNA并使 其聚集在膜上。
6、使上述RNA转移持续进行15hr左右。在转膜过程中,当纸巾浸湿后,应更换新的纸巾。
7、转移结束后,揭去凝胶上方的纸巾和3MM滤纸。将膜在6×SSC中浸泡5 min,以去除膜上残留的凝胶。
8、将凝胶置紫外灯下,观察胶块上有无残留的RNA。
9、膜置80℃,真空干烤1-2hr。烤干后的膜用塑料袋密封,4℃保存备用。
10、探针标记(Prime-a-Gene Labeling System, Promega公司):
① 取模板DNA 25ng于0.5ml离心管中,95-100℃变性5min,冰浴5min。
② dNTPmix的制备: 取dGTP 1μl、dATP 1μl、dTTP 1μl混匀。
③ 将下列反应成份混合,加入上述微量离心管中:
dNTPmix 2.0μl
BSA(10mg/ml ) 2.0μl
5×buffer 10.0μl
Klenow 酶(5u/μl) 1.0μl
α-32P-dCTP 5.0μl
加入适量dd H2O使反应总体积达50μl,轻轻混匀。室温下反应1hr。
11、预杂交:将膜的反面紧贴杂交瓶,加入预杂交液5ml,42℃预杂交3hr。
12、杂交:将变性的探针(95-100℃变性5min,冰浴5min)加入到预杂交液中,42℃杂交16hr。
13、洗膜:
① 倒去杂交液。
② 2×SSC/0.1%SDS室温洗15min。
③ 0.2×SSC/0.1%SDS,55℃洗15min×2次。
14、压片:将膜用ddH2O漂洗片刻,用滤纸吸去膜上水份。用薄型塑料纸将膜包好,置于暗盒中,在暗室中压上X光片。暗盒置-70℃放射自显影3~7天左右
好啦,Northern Blot实验的详细操作步骤我们就全部讲完啦!还有没看懂或者有关于Northern Blot实验操作细节要补充的同学欢迎留言分享给大家哦!