相信大家对单细胞都不陌生，就算没做过，也肯定听说过。很多做单细胞包发文的公司会告诉你“现在做单细胞就只能发个五六分了，不像以前好发”。这是普遍现象，但不是绝对现象。单细胞发文的新手福利期已过，SCI和标书的评委们对这样的技术手段司空见惯，因此逐渐对研究的深度及研究的价值提出了更高要求。如果要发文章，单细胞是一个不错的捷径；但如果要中“国自”，仅有单细胞，绝不足够。
请看国家自然科学基金-医学科学部对通讯评审的评阅要求——医学科学部将科学研究的“原创性”“真实可靠性”“科学意义和价值”作为项目评价的主要原则和标准，遴选出“具有真正创新思想”的研究项目和优秀人才，鼓励研究人员潜心探究、攻克具有“挑战性和变革意义的疑难科学问题”，培育并形成“十年磨一剑”的学术氛围。
那么如何提升单细胞测序技术的发文水平，为国自课题的申报助力呢？今天小编给大家提供一个研究案例，来自2022年10月22日，上海复旦大学陈晓军/赵冰合作课题组在《Nature Communications》期刊上发表的关于人子宫内膜样癌的起源和病理过程的研究。该研究团队通过单细胞转录组学分析绘制了人类正常子宫内膜向子宫内膜癌转变过程中不同细胞亚群细胞的动态图谱。
论文链接：https://doi.org/10.1038/s41467-022-33982-7
子宫内膜癌（EC）是继宫颈癌后第二常见的妇科恶性肿瘤之一，是发生于子宫内膜的一种上皮性恶性肿瘤，子宫内膜样癌（EEC）是EC的主要病理特征。在EEC肿瘤发生中，子宫内膜缺乏孕酮的保护，长期暴露于雌激素刺激下发生恶性增殖，正常子宫内膜逐渐发展为非典型子宫内膜增生（EEC癌前阶段）。关于EEC来源和正常子宫内膜向EEC演化过程中细胞亚群动态变化尚不清楚。因此，该研究通过单细胞转录组测序分析确定EEC的来源及发生过程中细胞亚群的动态变化，为子宫内膜癌的诊断和治疗提供新的方向。一、EEC很可能来源于子宫内膜上皮细胞而非基质细胞
该研究共收集了99,215个细胞，每个细胞产生了2317个检测基因的的中位数，聚类分为7个细胞簇。对比不同子宫内膜病理阶段（AEH、EEC）和正常人类子宫内膜样本细胞比例发现：来自不同病理阶段的子宫内膜基质纤维细胞与正常子宫内膜表现出高度相似性，而上皮细胞存在显著差异，表明EEC很可能来源于子宫内膜上皮细胞而非基质细胞。
二、无纤毛上皮细胞亚群的出现是子宫内膜癌发生的关键步骤
通过研究RNA速度分析预测细胞的发展轨迹发现无纤毛的腺细胞到致癌亚群有强烈的方向性流动，表明致癌亚群的来源最可能是无纤毛的腺细胞，充分证明AEH为EEC的前驱病变。表明独特的无纤毛上皮细胞亚群的出现是子宫内膜癌发生的关键步骤。
三、LCN2+SAA1/2+上皮细胞亚群是EEC形成的早期标志物
该研究通过对比子宫内膜病变不同阶段的免疫荧光染色证实，EPCAM + /LCN2 +和SAA1/2细胞出现在AEH和EEC样本中，但在正常子宫内膜中未出现，因此LCN2+/SAA1/2+上皮细胞亚群是EEC的早期标志物。
对比三个病理阶段免疫细胞聚类发现：EEC中细胞毒性CD8 T细胞和初始CD8 T淋巴细胞的比例显著降低，而与免疫抑制相关的FOXP3+CD4 Treg 淋巴细胞比例增加，表明免疫逃逸机制在EEC的发生过程中发挥着重要作用。
全文提炼
该研究通过对正常子宫内膜、AEH和EEC进行单细胞转录组学测序分析，揭示了EEC起源于无纤毛的腺上皮细胞和LCN2 + SAA1/2+细胞的出现是子宫内膜肿瘤形成的一个重要标志。描绘了内膜癌发生过程中肿瘤微环境和细胞亚群的动态变化，根据CD8淋巴细胞群比例下降，CD4 Treg细胞群的比例增加，推测免疫逃逸与子宫内膜癌的发生密切相关，为内膜癌细胞起源、早期诊断及临床治疗提供了新的线索方向。
单细胞测序指在单个细胞水平上进行基因组、转录组或表观组测序的技术，近几年单细胞测序技术取得飞速发展及瞩目成果，越来越多的高水平文章横空出世，在肿瘤、微生物、免疫学和神经科学等领域正在慢慢得到应用。普拉特泽生物已搭建全新单细胞多组学测序分析平台，拥有过硬的实验技术团队和丰富的项目经验可以为广大科研工作者和临床工作者提供更为优质的单细胞多组学服务，包括：单细胞转录组，单细胞转录组+V(D)免疫组联合分析，单细胞ATAC以及单细胞ATAC+mRNA联合分析。此外我们还提供利用Feature Barcoding的单细胞表面蛋白检测，及单细胞表面抗原特异性检测等服务。服务案例：
好，本期的精品导读就到这里
我们下期再见~
流式检测|病理检测|动物模型|实验服务|分子操作|免疫相关检测免费热线：18570028002
官网：http://www.uptbio.com
2023-06-30 14:48:14
湘公网安备