乳酸化修饰(Lactylation)是指在细胞代谢过程中,乳酸的积累修饰组蛋白上的赖氨酸残基。作为一种蛋白翻译后的修饰类型,在肿瘤发生、败血症和免疫疾病发生中发挥重要的作用。有研究证实,乳酸化修饰是乳酸发挥功能的重要方式,参与糖酵解相关细胞功能、巨噬细胞极化、血管功能、线粒体、神经系统调控等重要生命活动,可为肿瘤、免疫等领域的研究指引新方向。
本期仍旧提供三篇文献,今天给大家带来的是1篇相对分值不高的文章,先体验一下套路框架,月中和月底会带大家深度挖掘一下乳酸化的研究形式。
从pubmed数据来看,乳酸化从2013年才有文章上线。每年上线的文章总体呈现上升趋势,但到去年也就只有67篇。
既然上线的文章不多,那国自立项情况如何呢?项目的数量和资助的金额总体也是上升的。
总的来说,如果对表观遗传、RBP等大热的机制不感兴趣了,可以尝试乳酸化换个新口味。说了那么多,乳酸化怎么研究呢?接下来就奔主题,先看看低分文章如何研究乳酸化的吧... ...
Lactate-induced lactylation inskeletal muscle is associated with insulin resistance in humans.今年8月刚热乎乎的发表在 Front Physiol杂志上(IF=4.755)。Figure 1 人类骨骼肌乳酸化与肥胖和胰岛素敏感性的相关性
作者发现了一种趋势:肥胖个体的骨骼肌乳酸化水平高于瘦个体(13%,p = 0.09)。通过性别进一步分析乳酸化水平时发现,肥胖女性的骨骼肌乳酸化水平亦高于瘦的女性(19%,p < 0.05,图1A-1B)。同时,在所有个体中,空腹骨骼肌乳酸化与空腹血浆乳酸水平呈正相关(r = 0.47,p < 0.05,图1C)。Matsuda指数测量发现,胰岛素敏感性和肌肉的乳酸化水平呈负相关(r = -0.37,p < 0.05,图1D)。
Figure 2 人骨骼肌乳酸化与骨骼肌氧化代谢标志物呈负相关
相关性分析发现,骨骼肌乳酸化水平与骨骼肌乳酸脱氢酶(LDH)呈正相关(r = 0.46,p < 0.05,图2A)、与线粒体标记物COXIV呈负相关(r = -0.45,p < 0.05,图2B)。免疫印迹检测实验发现,肥胖者LDH-A高于体型偏瘦的,但是COXIV的表达高于体型偏瘦的(图 3B)。在对一些个体单独研究发现,与丙酮酸相关的复合物I在通透性肌纤维中的氧化磷酸化水平(OXPHOS)与骨骼肌乳酸化呈负相关(r = -0.71,p < 0.05,n = 8,图2D)。
Figure 3 乳酸诱导原代人骨骼肌细胞中IRS-1丝氨酸磷酸化
来看看细胞水平的实验结果:用不同浓度的乳酸处理HSKMC细胞24小时后,IRS-1蛋白636位丝氨酸上的磷酸化水平以剂量依赖的方式增加(p < 0.05,图3A)。在低糖(5.6 nM)和高糖(20 nM)培养基干预下,尽管HSkMC细胞中IRS-1总蛋白含量升高(约50%,p < 0.05,图3B),但LDH-A表达降低(约55%,p < 0.05),IRS-1蛋白 636位丝氨酸磷酸化水平降低(约48%,p < 0.01,图3B)。
Figure 4 乳酸诱导原代人类骨骼肌细胞中发生乳酸化
用乳酸处理原代HSkMC细胞24小时后,蛋白乳酸化以剂量依赖的方式增加(p < 0.005,图4)。为了确定内源性乳酸生成对骨骼肌乳酸化的影响,将HSkMC细胞给予增加浓度的葡萄糖、糖酵解化学抑制剂和LDH siRNA干预(图5A)。结果显示,肌管暴露增加(20 vs. 5.6 mM),高糖干预24小时后,乳酸积累增加(p < 0.05,图5B,D)、细胞乳酸化增加(约20%,P< 0.05,图6 A-C)。
接下来用2-DG(一种葡萄糖类似物,可以竞争性地抑制葡萄糖-6-磷酸的产生)对HSkMC细胞处理24小时,结果发现培养基上清液中的乳酸浓度降低(p < 0.05,图5B),同时以剂量依赖的方式降低了骨骼肌细胞乳酸化程度(p < 0.01,图6A)。
LDH-A化学抑制剂肟酸钠处理HSkMC细胞24h后,培养物中的乳酸浓度降低(约44%,p < 0.05,图5C)、细胞乳酸化程度降低(约18%,p < 0.05,图6B)。
最后,HSkMC细胞分别给予低和高浓度葡萄糖培养基培养,同时用LDH siRNA(LDH-A蛋白含量降低55%)干预,同样发现培养基中乳酸浓度降低(约36%,p < 0.05,图5D)、细胞乳酸化程度降低(约15%,p < 0.05,图6C)。
到此,一篇低分乳酸化的文章解读完毕,是不是很简单?
文章的思路不复杂,先是大数据的分析发现骨骼肌乳酸化与肥胖/胰岛素抵抗相关,然后分析骨骼肌乳酸化与氧化代谢产物的相关性。两次的相关性分析证实了猜想后,接下来就是细胞水平做验证。细胞实验的设置也比较简单,先找乳酸化位点,再通过不同的干预方式,确认位点的正确性。
文章通篇都在讲乳酸化,思路虽简单,但是与骨骼肌相关的临床实验数据获取难度较大。体外实验数据就相对比较简单,培养基中乳酸浓度测定采用乳酸分析仪即可,细胞乳酸化程度主要是采用WB的方法检测乳酸化泛抗体pan-kla的表达。