普拉特泽生物为广大生命科学研究人员提供非编码RNA的实验室检测技术，可根据实方案的要求选择不同的检测方法，本文就跟大家一起继续探究非编码RNA的实验室检测技术~非编码RNA（noncoding RNA）的实验室检测技术是当前生物学研究的热点之一，这些技术为我们揭示非编码RNA的功能和作用机制提供了强有力的工具。以下是一些常用的非编码RNA实验室检测技术：

一、RNA原位杂交（RNA in situ hybridization）

RNA原位杂交技术是一种用于检测特定RNA分子在细胞或组织中的位置和分布的方法。通过将特定标记的已知顺序核酸作为探针，与细胞或组织切片中的核酸进行杂交，可以对特定核酸顺序进行精确定量定位。
这项技术常被用于检测非编码RNA是否位于核内，从而判断其是否与DNA相互作用。

二、ChIRP（Chromatin isolation by RNA purifications）

ChIRP是一项通过纯化RNA分子从而获得其结合的染色质片段（包括RNA结合蛋白与基因组DNA）的实验方法。该技术首先通过细胞交联使RNA、染色质及被固定连接，然后通过超声将染色质打断
并使用带有生物素标记的tiling oligos与RNA分子杂交。接下来，利用亲和素磁珠纯化RNA及其结合的染色质片段，并进行后续分析和测序。ChIRP技术可用于研究非编码RNA与DNA的相互作用，以及鉴定非编码RNA在基因组上的结合位点。

三、CLASH（crosslinking-ligation and sequencing of hybrids）

CLASH技术是一种用于研究RNA分子与RNA分子相互作用的实验系统，特别适用于鉴定miRNA与其靶mRNA的相互作用。该技术首先对细胞进行交联处理，将miRNA及其靶mRNA与RISC复合物固定连接。
然后，通过Co-IP富集纯化RISC复合物，并通过分子内连接将miRNA的3'-OH末端与靶mRNA的5'-PO4末端连接，形成一条长的单链RNA。
最后，对这条单链RNA进行测序，从而揭示miRNA与其靶mRNA的相互作用关系。

四、CHART（Capture Hybridization Analysis of RNA Targets）

CHART技术，也被称为RNA precipitation，是一种用于研究RNA-DNA相互作用的技术。它根据非编码RNA序列设计探针，将二次探针交联在固相载体上。若将核内RNA-DNA状态固定处理，染色质超声打碎成小片段，
RNA-DNA的结构就可以被探针抓取下来。然后，利用DNA-Seq对抓取的DNA进行测序，获得DNA结合序列的信息。
这项技术可用于鉴定非编码RNA在基因组上的结合位点，并揭示其与DNA的相互作用机制。

五、CLIP-seq

CLIP-seq是将紫外交联免疫共沉淀技术（CLIP）与高通量测序技术相结合的技术，用于鉴定与特定RNA结合蛋白相互作用的RNA分子。该技术首先通过紫外照射将细胞内的RNA分子与RNA结合蛋白进行耦联，
然后通过细胞裂解、免疫共沉淀和核酸酶切割等步骤，保留蛋白质内部的RNA片段。最后，通过高通量测序揭示与特定RNA结合蛋白相互作用的RNA分子。
CLIP-seq技术可用于研究非编码RNA与蛋白质的相互作用，并鉴定非编码RNA的结合蛋白。

六、RNA pull down

RNA pull down技术是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的重要实验手段。它利用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合
从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过Western Blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。这项技术可用于验证非编码RNA与特定蛋白质之间的相互作用。

七、荧光定量PCR

荧光定量PCR是一种常用的检测非编码RNA表达水平的方法。由于非编码RNA通常具有特定的序列特征，因此可以设计特定的引物和探针进行荧光定量PCR检测。该技术具有灵敏度高、特异性强和定量准确等优点，可用于研究非编码RNA在不同细胞或组织中的表达水平及其调控机制。综上所述，非编码RNA的实验室检测技术多种多样，每种技术都有其独特的优点和适用范围。在实际研究中，应根据研究目的和实验条件选择合适的检测技术，以揭示非编码RNA的功能和作用机制。

好，今天关于非编码RNA的实验室

检测技术

就说到这里

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