DNA pull-dwon实验介绍【pull dwon外包】
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
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DNA Pull down实验是用脱硫生物素标记特异性DNA探针,脱硫生物素探针可以和偶联在磁珠上的链霉亲和素亲和结合。提取物与磁珠-DNA探针孵育,作用蛋白质分子可以和DNA探针特异性结合;经过洗涤可以将非特异性结合蛋白质去除;用 Western Blot或质谱对产物进行检测分析。
一、实验流程
一般来说,该实验首先,需要针对待研究目的基因的调控区域设计并制备特异性探针(以脱硫生物素标记为主流);同时,制备细胞核提取物;将探针和核提取物共同孵育,DNA结合蛋白就会和靶向序列特异性结合;然后,通过亲和素磁珠纯化蛋白质DNA复合物;最后针对获得的蛋白,使用Western blot验证或者质谱方式鉴定蛋白质类型。
二、 DNA pull-down技术应用
DNA pull-down以感兴趣的DNA序列为探针,寻找与该序列结合的蛋白质,最常见的应用是寻找某特定基因启动子区域的转录因子。
a. DNA Pull down WB,用于检测目标DNA序列与某样本中的待测蛋白是否存在相互作用;
b. DNA Pull down MS,用于筛选目标DNA序列与某样本中的哪些蛋白具有相互作用。
三、RNA pulldown优缺点:
① 富集分析低丰度蛋白;
② 探针制备简便,周期短;
③ 获得特异性蛋白与下游蛋白质检测技术兼容;
缺点:
① 长连探针往往存在非特异结合现象;
② 反应条件要求无核酸酶;
③ 体外实验,相对体内实验存在一定弊端;
四、RNA pulldown实验步骤
1.探针设计及标记
2.样本前处理
3. Pull down
4.蛋白质检测-- Western blot
5.蛋白质检测-- MS
好啦,DNA pull-down实验就简单介绍到这里啦,结尾给大家简单介绍了一下实验的框架流程,下期根据这个流程给大家详细分享DNA pull-down实验的详细步骤,如果您也对DNA pull-down实验感兴趣或有DNA pull-down外包的需求,欢迎选择咱们普拉特泽生物!下期见~