大家好！今天普拉特泽生物继续跟大家一起学习新的实验文章——CDS和ORF的区别

在基因组学和分子生物学的探索中，NCBI（美国国家生物技术信息中心）扮演着至关重要的数据库角色。当我们在NCBI中查阅基因序列信息时，经常会碰到“ORF”和“CDS”这两个概念。它们都与基因中负责编码蛋白质的区域紧密相关，但在具体定义和应用上却有所区别。简单来说，“ORF”指的是开放阅读框，是基因序列中一段可能编码蛋白质的连续核苷酸序列；而“CDS”则代表编码序列，是已经确证为编码特定蛋白质的核苷酸序列区域。

首先我们先搞清楚何为ORF？

在分子生物学中，开放阅读框（Open Reading Frame，ORF）从起始密码子开始，结束于终止密码子连续的碱基序列，是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列。
何为CDS？

与蛋白序列一一对应的DNA序列，并且序列中间不存在其他与蛋白无关的序列

ORF（开放阅读框）和CDS（编码序列）的区别与联系：

定义与性质

ORF：在DNA或RNA序列中，从起始密码子到终止密码子之间的一段连续的非中断的核苷酸序列。它是预测可能编码蛋白质的区域，但并非所有预测的ORF都能实际编码出有功能的蛋白质。

CDS：是基因中直接参与蛋白质合成的DNA片段，是已经确证为编码特定蛋白质的核苷酸序列区域。CDS与mRNA序列一一对应，且中间不存在其他非编码序列（如内含子）。

确定性与预测性：

ORF：是一种预测结果，基于序列分析得出的可能编码蛋白质的区域。它可能包含多个，但并不是所有预测的ORF都能被证实为实际的编码序列。

CDS：是已经通过实验验证或数据库注释确认的编码序列，具有更高的确定性和可靠性。

包含关系：

CDS必定是ORF：因为CDS是已经确证的编码序列，它必然符合从起始密码子到终止密码子的连续非中断序列的定义，因此它一定是一个ORF。

ORF不一定是CDS：预测的ORF可能包含不能编码蛋白质的序列，或者可能包含多个CDS

今天关于CDS和ORF的区别就分享到这儿啦~如果您在实验过程中遇到技术问题，或者需要实验外包和代做，可与我们技术老师联系18570028002（微信同号）