实时荧光定量PCR检测步骤和注意事项【附视频教程】
来源/作者:普拉特泽生物-医学整体课题外包
一、实时荧光定量PCR的概念
什么是QPCR?实时荧光定量PCR检测技术是指在PCR反应体系中加入可与DNA产物异形结合的荧光基团,利用荧光信号积累监测整个PCR过程,最终通过相对定量和绝对定量的方法确定各个样本的表达量。
二、QPCR实验的应用及分类
关于QPCR绝对定量和相对定量的应用,绝对定量技术通常在病原体检测、转基因食品检测以及基因表达研究中应用比较广泛;相对定量应用于mRNA表达量分析、siRNA干扰效果的验证和基因过表达以及基因芯片效果的验证。
三、QPCR技术的两大分类优缺点对比
四、实时荧光定量PCR的实验步骤:
1、样本制备;
2、RNA提取;
3、反转录;
4、QPCR引物设计及预实验;
5、实时荧光定量QPCR数据分析。
五、QPCR实验技术有哪些注意事项
1、扩增曲线和熔解曲线
对于QPCR实验中涉及到的扩增曲线和熔解曲线需要做如下的要求,由于扩增曲线是反映PCR循环数与荧光强度的一条曲线,所以这条曲线要平滑完整,而熔解曲线是将温度与荧光强度的变化求导得到是对数图谱,所以要求熔解曲线是单一峰;
2、Ct值
同样是QPCR实验中需要注意的重要参数,它是PCR扩增过程中,扩增产物的荧光信号达到设定阈值时所经过的扩增循环次数,也就是说,我们达到一个平台期的时候,Ct值的起始value与平台期之间存在一个Ct循环数的差异,我们称之为该基因的扩增倍数。经过了多少个循环数达到平台期所求出来的差值就是我们的Ct值。其特点是DNA模板量越多,达到荧光阈值的循环数越少,所以Ct值越小。
如图所示,它的Ct value越偏向于右边,它的起始模板量越少,越偏向于左边,起始模板量越高。而它们最终都是要达到一个平台期的。
3、反应体系配置
配置体系时需要注意以下几点:
①SYBR MasterMix不要反复冻融;
②在一个管中配置Mix,减少加样误差;
③所有成分加完后,离心去除气泡;
④每个样品至少3-4个平行孔,方便进行统计学分析;
⑤需设置NTC阴性对照组,验证实验材料是否具有污染。
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