血管生成实验结果分析教程——细胞实验外包
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
血管形成实验结果数据分析由普拉特泽生物给大家总结分享。血管形成实验在肿瘤医学的研究与治疗中一直是实验热点,我们的细胞实验平台也承接了上百例血管生成实验代做服务,血管生成是一个极其复杂的过程,包括血管内皮细胞基质的降解、内皮细胞移行、增殖、管道分化等各种步骤。今天咱们就来看看已经成功形成了血管的实验结果应该有哪些量化指标与分析步骤吧!
我们常用的量化指标有:number of tubes; number of loops/meshes; number of branch sites/nodes; length of tubes。文献中常用的分析指标是branch points与capillary length:
现在我们来看看使用ImageJ插件Angiogenesis Analyzer对血管网络进行定量的详细步骤!
详细步骤:1、ImageJ软件File -> Open打开待分析图片:
也可通过点击Angiogenesis Analyzer插件,下载示例图片:
下载完成后示例图片会保存在文件夹中:
2. 打开Angiogenesis Analyzer文本文件,即可见Angiogenesis Analyzer分析界面:
点击扳手形状选择Settings可设置测量参数:
点击Network analysis分析界面,Angiogenesis Analyzer插件可以分析小管形成明场图片(Phase Contrast)或荧光图片(Fluo):
本图片为明场图片,点击Analyze HUVEC Phase Contrast,等待分析完成后即可得到分析结果:
3. File -> Save as…即可保存结果到Excel表格,Angiogenesis Analyzer插件可以得到如下诸多结果:
4. Angiogenesis Analyzer插件Analyze Binary Tree也可以分析二值化的网络结构(如神经元、血管等):
参考文献:
1. DeCicco-Skinner KL, Henry GH, Cataisson C, et al. Endothelial cell tube formation assay for the in vitro study of angiogenesis. J Vis Exp. 2014
2. Carpentier, G. ImageJ contribution: Angiogenesis Analyzer. ImageJ News. 2012
3. Wüstehube J, Bartol A, Liebler SS, et al. Cerebral cavernous malformation protein CCM1 inhibits sprouting angiogenesis by activating DELTA-NOTCH signaling. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010;107(28):12640-5
好啦,那今天给大家分享的血管形成实验结果分析就到此为止了,希望能给到大家实验操过程中的一定的帮助,如果您有血管生成实验外包的需求,欢迎随时留言哦!我们下期见~