QPCR检测实验详细的步骤与报告(二)
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
普拉特泽生物为广大生命科学研究人员提供QPCR检测实验,可根据实方案的要求选择不同的检测方法,本文就跟大家一起继续阐述QPCR检测实验详细的步骤与报告。
一、实验目的
通过QPCR实验技术定量检测基因表达量。
二、实验样品及分组
1. 实验样本
备注:包括干预细胞用的相关试剂均按实验样品登记,每行登记一个或一组独立样品。
2 .实验分组
细胞: SH-SY5Y
分组:
常规培养条件:完全培养基,95%空气+5%二氧化碳;
OGD培养条件:无糖Earle液,95%氮气+5%二氧化碳处理4h,复氧复糖24h
指标:1、核质分离后检测lncRNA BDNF-AS(NR_002832.2)
2、提取总RNA检测BDNF(Gene ID: 627)、APP( Gene ID: 351)、BACE1( Gene ID: 23621)、BDNF-AS的表达(默认最长的转录本)
三、实验结果
四、实验材料
1.主要实验仪器
2.主要实验试剂及耗材
五、实验原理
QPCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。根据荧光信号的变化能够实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过Ct值和标准曲线的分析就能对起始模板进行定量分析。
六、实验步骤
1.引物设计
2.样品前期处理
向细胞样本中加入500 μl Trizol。
3. RNA提取
(1) 向加有Trizol的1.5 ml EP管中加入100 μl氯仿,震荡混匀后,静置5 min,在12000 rpm,4度离心10 min。
(2) 从离心机中取出1.5 ml EP管,再将上层无色透明的水相层吸入到另一干净的1.5 mlEP管中。(样品会分为三层:下层有机相层,中间层和上层的水相层,RNA位于上层水相中。)加入等体积的异丙醇,上下轻轻颠倒混匀之后,静置10 min,再12000 rpm,4度离心10 min。
(3) 离心之后可在EP管壁或管底看到胶状沉淀出现,沉淀就是要提取的RNA。小心弃去上清,不要将沉淀倒掉了。
(4) 用1 ml 75℅乙醇对RNA沉淀进行洗涤。然后于4℃ 7000 rpm离心5分钟,将上清尽量去除干净。
(5) 室温静置干燥,大约干燥5~10分钟即可。(不要真空离心干燥,过于干燥会导致RNA的溶解性大大降低)。所有EP管中加入25 μl 的DEPC H2O,用枪头吹打几次,使RNA充分溶解,-80℃保存。
(6) RNA浓度检测:使用核酸蛋白检测仪检测RNA浓度。
4.RNA浓度及纯度测定
(见实验结果部分)
5.逆转录PCR
1. 按以下组份分别配制逆转录反应液:
2.cDNA立刻进行实验或者置于4℃保存。
六、实时荧光定量PCR反应
1. 反应体系的配置
2.反应条件设置:
扩增程序:
3.熔解程序
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