外泌体是胞内多泡体与细胞膜融合后，释放到细胞外的膜性小囊泡，是细胞间信号传输的载体。2013年，诺贝尔生理学或医学奖授予了三位科学家，表彰其在细胞间囊泡运输调控机制领域作出突出贡献，将外泌体研究的热度推向高潮。近几年外泌体成为科研热点，相关论文发表数量呈爆炸式增长。

也许很多老师苦于外泌体研究如此火爆却无从介入

其实，外泌体就是一种特殊的研究对象，几乎所有生物研究领域，都可以全新的视角从外泌体角度深入挖掘，给自己的研究锦上添花！帮大家盘一盘外泌体数据库，看看您是不是可以从这些数据库中找到一些灵感和研究基础。

1

ExoCarta数据库（http://www.exocarta.org/）

ExoCarta是首个外泌体标志物综合数据库，由小恩家首席科学家Simpson教授团队建立，是一个开放的数据库平台，收录了包括人、大鼠、小鼠、绵羊、豚鼠、果蝇、马、穴兔、牛在内的几个物种共286个研究结果；涉及到不同组织器官来源的外泌体蛋白，mRNA，miRNA，脂类等信息。ExoCarta数据库的典型特点就是具有外泌体蛋白动态的蛋白与蛋白之间相互关系网以及生物学通路。用户可以从大量的研究中下载最常用的蛋白数据。下载的文件可直接导入FunRich工具，进行其他的功能富集和相互关系网分析。该数据库已经被超过16000名独立研究人员使用。

2

exoRBase（http://www.exorbase.org/）

exoRBase是人类血液外泌体长链RNA-seq数据库，同时也包括已发表文献的实验验证。该数据库目前共收录92例血液样本，58330个circRNA、15501个LncRNA和18333个mRNA，并提供了注释、表达水平和可能的来源组织。exoRBase主要特点是对标准化RNA-seq数据的RNA表达谱进行了整合和可视化。数据涵盖了健康对照者32例，冠状动脉心脏疾病（CHD）6例，结肠癌（CRC）12例，肝细胞癌（HCC）21例，胰腺腺癌（PAAD）14例，乳腺癌2例。

3

EVmiRNA（http://bioinfo.life.hust.edu.cn/EVmiRNA）

EVmiRNA，顾名思义，一种细胞外囊泡（EVs）的miRNA数据库，收录了17种器官或疾病462个EVs小RNA测序样本miRNA表达谱。该数据库提供了3种功能性模块：(i) miRNA表达情况及EVs来源样本信息（如血液，乳汁等）；(ii)不同EVs种特异表达的miRNA，便于biomarker筛选研究；(iii)miRNA注释信息包括EVs中miRNA表达情况，TCGA癌症类型，miRNA调控通路以及miRNA功能及相关文献，为细胞外囊泡的miRNA研究提供重要资源。

4

EV-TRACK（http://www.evtrack.org/）

EV-TRACK是以Thery为首的EV-TRACK联盟建立的EVs研究透明报告在线数据库，其中包含了EVs相关文献的方法学参数，基于MISEV（EVs研究最小实验要求）评估EVs分离及鉴定相关参数。该数据库的建立旨在规范EVs研究，便于将实验规范应用于实际研究中，对实验结果进行解释和重复。

5

EVpedia （http://evpedia.info）

EVpedia是一个原核和真核生物EVs的高通量数据综合数据库，该数据库提供原核生物、非哺乳类真核生物和哺乳动物囊泡组分（蛋白质、mRNA、miRNA、脂质）的高通量分析数据。除此之外，该数据库还提供了一系列分析工具，可用于检索和浏览囊泡成分、Gene Ontology富集分析、囊泡蛋白和mRNA的网络分析，以及通过直接同源鉴别比较囊泡数据。同时，该数据库中还列出EVs研究的相关文献。这个免费的数据库可以作为EVs研究进展的一个基本资料库，有助于阐明这些复杂胞外囊泡的新功能。

6

Vesiclepedia（http://www.microvesicles.org/）

Vesiclepedia是一个EVs分子数据（脂质、RNA和蛋白质）的手工检索数据库，收录了41个物种的1254个独立研究，349988个蛋白，27646个mRNA，10520个miRNA、639个脂质条目，还可以根据物种、囊泡、分子和样品类型浏览和检索。

该数据库是公开的，允许用户根据不同的搜索标准查询和下载EV cargo、 EV分离和表征模式，生物物理和分子特性以及EV-METRIC，帮助生物医学科学家评估EV制剂的质量，获得的相应数据。此外，基于FunRich的Vesiclepedia插件可以帮助用户进行数据分析。

7

EMBL-EBI外泌体数据库（http://www.ebi.ac.uk/GOA/exosome）

EMBL-EBI外泌体数据库是一款针对人类外泌体蛋白GO功能分析的综合注释数据库。该数据库与实验室研究人员（Dr S Mathivanan - La Trobe Institute, Dr A Kalea - UCL）及外泌体数据库Exocarta (http://www.exocarta.org/) 和Vesiclepedia紧密合作，识别用于聚焦注释的靶蛋白以及外泌体实验方法学的注释。

8

Urinary Exosome Protein Database （https://hpcwebapps.cit.nih.gov/ESBL/Database/Exosome/）

Urinary Exosome Protein Database——尿液外泌体蛋白数据库是基于上皮系统生物实验室（ESBL）已发表的蛋白质谱数据建立的数据库，所有数据均来源于健康志愿者尿液外泌体。这个数据库包含了用两种不同的质谱仪来鉴定人类尿外泌体的蛋白质。

本文来自：科研小助手整理自帮研网、生物医学科研之家