什么是实时荧光定量PCR?
来源/作者:普拉特泽-生物医学整体课题外包平台
大家好~今天跟大家一起学习的是实时荧光定量PCR实验,普拉特泽生物跟大家一起从实验的介绍、实验步骤、操作注意事项、常见问题这四个方面跟大家一起学习,本篇及时实时荧光定量PCR的一个简单介绍,一起来看吧!
实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和Log模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。
实时荧光定量PCR的原理是:在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光,随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增而变化荧光信号强度,求得Ct值,同时利用数个已知模板浓度的标准品作对照,即可得出待测标本目的基因的拷贝数。
实时荧光定量的检测方法主要是分为两种:SYBRGreenⅠ法和TaqMan探针法
1、SYBRGreenⅠ法:
在PCR反应体系中,加入过量SYBR荧光染料,SYBR荧光染料特异性地掺入DNA双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。
SYBR定量PCR扩增荧光曲线图
PCR产物熔解曲线图(单一峰图表明PCR扩增产物的单一性)
2、TaqMan探针法:
探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物的形成完全同步。
那么实时荧光定量PCR在实际的生活中有哪些应用呢?
1、临床疾病诊断
各型肝炎、艾滋病、禽流感、结核、性病等传染病诊断和疗效评价;地中海贫血、血友病、性别发育异常、智力低下综合症、胎儿畸形等优生优育检测;肿瘤标志物及瘤基因检测实现肿瘤病诊断;遗传基因检测实现遗传病诊断。
2、动物疾病检测
禽流感、新城疫、口蹄疫、猪瘟、沙门菌、大肠埃希菌、胸膜肺炎放线杆菌、寄生虫病等、炭疽芽孢杆菌。
3、食品安全
食源微生物、食品过敏源、转基因、乳品企业阪崎肠杆菌等检测。
4、科学研究
医学、农牧、生物相关分子生物学定量研究。
好啦,那实时荧光定量PCR我们就简简单单的介绍到这里啦!下期跟大家分享实时荧光定量的PCR的操作步骤!如果您有实时荧光定量PCR实验外包的需求的话欢迎留言,我们会及时回复的哦!